Harbi1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Harbi1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-08379

品系全称

C57BL/6JCya-Harbi1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-241547-Harbi1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Harbi1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-08379) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
harbinger transposase derived 1
基因别称
D230010M03Rik
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_178724.5 | Ensembl: ENSMUST00000090608
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~1238 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Harbi1基因是一个重要的基因,它编码的蛋白质在多种生物学过程中发挥着重要作用。Harbi1基因来源于Harbinger转座子,是一种在原核生物、植物、昆虫、蠕虫和脊椎动物中广泛存在的DNA转座子。Harbinger转座子编码两种蛋白质:一种是超家族特异性的转座酶,另一种是具有保守的SANT/myb/trihelix基序的DNA结合蛋白。这种基序对于不同的转录调节因子结合DNA非常重要,因此推测这种蛋白质对于协调Harbinger转座酶的表达是必要的[1]。

尽管哺乳动物基因组中没有可识别的Harbinger转座子的遗迹,但是研究发现了一个广泛表达的HARBI1基因,它编码一个350个氨基酸的蛋白质,完全来源于大约4.5亿年前的一个Harbinger转座酶。HARBI1蛋白质在人类、大鼠、小鼠、牛、猪、鸡、青蛙和各种硬骨鱼中是保守的,与其他重要的蛋白质,如RAG1和RAG2一起,共同构成了一个保守的蛋白质家族。HARBI1蛋白质在硬骨鱼类的功能中发挥着重要作用,并且它们与一个自主的Harbinger 3_DR转座子编码的蛋白质最为相似,这个转座子在几百万年前的斑马鱼基因组中是活跃的。非自主的Harbinger3_DR转座子具有对17个碱基的目标位点的强烈偏好,这在其他DNA转座子中是前所未有的。因此,推测HARBI1核酶也具有对DNA目标的强烈特异性[1]。

此外,研究发现了一些新型的棉花启动子,它们在棉花受到棉铃象甲(CBW)侵染时表现出强烈的响应,并在植物的绿色和生殖组织中表现出强大的活性,这为转基因作物在害虫控制中的应用提供了新的可能性[2]。在活化石腔棘鱼的基因组中,也发现了活跃的Harbinger转座子,这表明Harbinger转座子在脊椎动物基因组的进化和功能中发挥着重要作用[3]。

在植物中,Harbi1基因也被发现具有重要的功能。例如,MdHARBI1是苹果中一个与MdATG8i相互作用的蛋白质,它通过影响自噬途径在植物的热耐受性中发挥着关键作用[4]。OsHARBI1-1是水稻中一个对镉胁迫响应的基因,它通过增强细胞壁厚度和激活抗氧化酶的表达来提高植物对镉的耐受性[5]。在虾中,HARBI1-like蛋白质在白斑综合症病毒和溶藻弧菌感染中发挥着重要的免疫调节作用,它通过调节细胞凋亡、酚氧化酶活性和超氧化物歧化酶活性来提高虾的免疫力[6]。

综上所述,Harbi1基因是一个重要的基因,它编码的蛋白质在多种生物学过程中发挥着重要作用。Harbi1基因在硬骨鱼类、植物和虾等生物中具有保守性,并且与多种生物学过程相关,包括免疫调节、自噬、抗逆性和金属耐受性。Harbi1基因的研究有助于深入理解基因的功能和进化的机制,为生物技术和疾病治疗提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Kapitonov, Vladimir V, Jurka, Jerzy. . Harbinger transposons and an ancient HARBI1 gene derived from a transposase. In DNA and cell biology, 23, 311-24. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15169610/
2. de Moura, Stéfanie Menezes, Freitas, Elinea Oliveira, Ribeiro, Thuanne Pires, Alves-Ferreira, Marcio, Grossi-de-Sa, Maria Fatima. 2022. Discovery and functional characterization of novel cotton promoters with potential application to pest control. In Plant cell reports, 41, 1589-1601. doi:10.1007/s00299-022-02880-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35665839/
3. Smith, Jeramiah J, Sumiyama, Kenta, Amemiya, Chris T. 2011. A living fossil in the genome of a living fossil: Harbinger transposons in the coelacanth genome. In Molecular biology and evolution, 29, 985-93. doi:10.1093/molbev/msr267. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22045999/
4. Huo, Liuqing, Guo, Zijian, Wang, Ping, Xu, Kai, Ma, Fengwang. 2021. MdHARBI1, a MdATG8i-interacting protein, plays a positive role in plant thermotolerance. In Plant science : an international journal of experimental plant biology, 306, 110850. doi:10.1016/j.plantsci.2021.110850. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33775357/
5. Sun, Baozhen, Qian, Xiyi, Zhu, Fei. 2018. Molecular characterization of shrimp harbinger transposase derived 1 (HARBI1)-like and its role in white spot syndrome virus and Vibrio alginolyticus infection. In Fish & shellfish immunology, 78, 222-232. doi:10.1016/j.fsi.2018.04.032. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29680489/
6. Sinzelle, Ludivine, Kapitonov, Vladimir V, Grzela, Dawid P, Izsvák, Zsuzsanna, Ivics, Zoltán. 2008. Transposition of a reconstructed Harbinger element in human cells and functional homology with two transposon-derived cellular genes. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 105, 4715-20. doi:10.1073/pnas.0707746105. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18339812/