Tom1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Tom1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-06410

品系全称

C57BL/6JCya-Tom1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-21968-Tom1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Tom1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-06410) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
target of myb1 trafficking protein
基因别称
-
染色体号
Chr 8 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001136259 | Ensembl: ENSMUST00000078847
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3~6
敲除长度
~2.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因Tom1是一种在多种生物体中发现的基因,它编码的蛋白质在细胞内具有多种功能。在真菌中,Tom1基因被认为是MAT1-1-1转录因子的主要靶点之一,MAT1-1-1转录因子是真菌交配型基因座编码的转录因子,负责调控真菌的性繁殖和其他发育过程。研究表明,Tom1基因编码的蛋白质高度保守,在Eurotiomycetes真菌中广泛存在[1]。Tom1基因编码的蛋白质含有核定位序列,其核定位已被荧光显微镜所证实。通过荧光显微镜,研究人员发现MAT1-1-1与Tom1启动子结合,并通过电泳迁移率变动实验(EMSA)进一步证实了Tom1启动子序列在体外被MAT1-1-1和MAT1-2-1结合。这表明两种转录因子之间存在相互作用,这种相互作用通过酵母双杂交分析得到了证实。在真菌中,Tom1基因的缺失导致明显的分生孢子形成缺陷,特别是在31°C的高温下更加明显[1]。

在植物中,Tom1基因被认为是Tobamovirus multiplication(TOM)基因家族的成员,这些基因在Tobamovirus病毒的复制中发挥重要作用。Tobamovirus是一类感染多种植物的RNA病毒。研究表明,Tom1基因编码的蛋白质是一种跨膜蛋白,对于Tobamovirus病毒在植物中的有效复制至关重要[3]。通过CRISPR/Cas9技术对烟草中的Tom1基因进行编辑,成功地使烟草植物对烟草花叶病毒(TMV)产生了抗性[2]。此外,对Tom1基因家族成员的进化分析表明,Tom1家族在植物界中保守,可能起源于Chlorophyta类群,并且Tom1家族在促进Tobamovirus复制的能力在植物种间是高度保守的[4]。

在动物中,Tom1基因编码的蛋白质属于VHS结构域蛋白家族,VHS结构域蛋白在细胞内运输和分选中发挥作用。研究表明,Tom1蛋白能够直接与泛素链和Tollip结合,形成复合物。此外,Tom1还能够通过典型的clathrin结合基序与clathrin重链结合。荧光显微镜分析显示,Tom1蛋白主要定位于细胞质中,而其缺乏clathrin结合基序的突变体在整个细胞中呈弥散性分布。这表明Tom1-Tollip复合物可能作为将泛素化蛋白与clathrin连接起来的因子[5]。

在人类中,Tom1基因位于22号染色体上,其编码的蛋白质与HGS(肝细胞生长因子调节的酪氨酸激酶底物)和STAM(信号转导适配子分子)相似,这些蛋白质与内体的囊泡转运有关。Tom1基因的表达在骨骼肌、大脑和肠道中最为丰富。此外,还发现了一个人类Tom1基因的旁系同源基因(TOM1-like gene 1)[6]。

综上所述,Tom1基因在真菌、植物和动物中具有不同的功能。在真菌中,Tom1基因编码的蛋白质参与调控真菌的性繁殖和分生孢子形成。在植物中,Tom1基因编码的蛋白质对于Tobamovirus病毒的复制至关重要,并且通过CRISPR/Cas9技术对Tom1基因进行编辑可以产生对病毒的抗性。在动物中,Tom1基因编码的蛋白质参与细胞内运输和分选过程。在人类中,Tom1基因位于22号染色体上,其编码的蛋白质与内体的囊泡转运有关。Tom1基因的研究有助于深入理解其在不同生物体中的功能和作用机制。

参考文献:
1. Ramšak, Barbara, Kück, Ulrich. 2022. The Penicillium chrysogenum tom1 Gene a Major Target of Transcription Factor MAT1-1-1 Encodes a Nuclear Protein Involved in Sporulation. In Frontiers in fungal biology, 3, 937023. doi:10.3389/ffunb.2022.937023. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37746180/
2. Jogam, Phanikanth, Sandhya, Dulam, Alok, Anshu, Zhang, Baohong, Allini, Venkateswar Rao. 2023. Editing of TOM1 gene in tobacco using CRISPR/Cas9 confers resistance to Tobacco mosaic virus. In Molecular biology reports, 50, 5165-5176. doi:10.1007/s11033-023-08440-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37119416/
3. Yamanaka, T, Ohta, T, Takahashi, M, Naito, S, Ishikawa, M. . TOM1, an Arabidopsis gene required for efficient multiplication of a tobamovirus, encodes a putative transmembrane protein. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 97, 10107-12. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/10944200/
4. Zhang, Hui, Hu, Qun. 2023. TOM1 family conservation within the plant kingdom for tobacco mosaic virus accumulation. In Molecular plant pathology, 24, 1385-1399. doi:10.1111/mpp.13375. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37443447/
5. Yamakami, Megumi, Yoshimori, Tamotsu, Yokosawa, Hideyoshi. 2003. Tom1, a VHS domain-containing protein, interacts with tollip, ubiquitin, and clathrin. In The Journal of biological chemistry, 278, 52865-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14563850/
6. Seroussi, E, Kedra, D, Kost-Alimova, M, Imreh, S, Dumanski, J P. . TOM1 genes map to human chromosome 22q13.1 and mouse chromosome 8C1 and encode proteins similar to the endosomal proteins HGS and STAM. In Genomics, 57, 380-8. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/10329004/