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Tbp-flox 基因敲除小鼠

Tbp-flox 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Tbp-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-05753

品系全称

C57BL/6JCya-Tbpem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-21374-Tbp-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Tbp-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-05753) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
TATA box binding protein
基因别称
GTF2D1，Gtf2d，SCA17，TFIID
染色体号
Chr 17 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_013684 | Ensembl: ENSMUST00000162505
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~1.3 kb
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:101838Mice homozygous for one null allele exhibit embryonic lethality caused by hemorrhaging and clotting in the placenta and surviving embryos die prior to weaning. Mice homozygous for another null allele undergo growth arrest after hatching and apoptosis.
更多信息
TBP，即TATA盒结合蛋白（TATA-box binding protein），是一种在真核生物中广泛存在的转录因子，它参与了RNA聚合酶II转录的启动过程。TBP的主要功能是与TATA盒序列结合，这一序列通常位于基因启动子的核心区域，是许多基因转录启动所必需的。TBP与TATA盒的结合是形成转录起始复合物（pre-initiation complex, PIC）的关键步骤，PIC的进一步组装最终导致转录的启动[1]。

TBP的活性受到多种TBP相关蛋白的调节，这些蛋白通过与TBP相互作用，影响TBP与DNA的结合能力以及TBP在转录过程中的功能[1]。例如，SAGA转录共激活因子复合物在转录激活中起着重要作用，它不仅包含多个染色质修饰酶模块，还包括一个将TBP递送到基因启动子的模块。最近的研究表明，SAGA复合物中存在一个由八个组蛋白折叠结构域组成的八聚体核心，为TBP的结合提供了空间，并且其结构特点有助于减少与错误DNA序列的非特异性相互作用。这些结构上的特点为理解TBP如何被精确地递送到基因启动子上以及SAGA如何调节基因表达提供了结构基础[3]。

TBP在维持基因表达的调控中也发挥着重要作用。研究表明，TBP的二聚化对于防止其无调节的基因表达和自身的降解是必要的。在酵母中，TBP二聚化的缺陷会导致基因表达失控和TBP的快速降解[4]。这表明，TBP的二聚化可能在维持基因表达的精确调控中起着关键作用。

此外，TBP在植物中同样发挥着重要的功能。在拟南芥中，两个TBP同源物在RNA聚合酶II和III的转录中发挥着相同的功能，这表明植物中的TBP可能具有比酵母中更广泛的结合特异性[5]。这提示，TBP在不同生物中的功能可能存在差异，并且其功能可能受到其他相关蛋白的调节。

在人类癌症研究中，TBP也被作为基因表达研究的参考基因。最近的研究发现，TBP的表达在结直肠癌细胞系、类器官和患者组织中在辐射治疗后表现出了较高的稳定性，因此被认为是一种潜在的参考基因，用于标准化定量PCR（qPCR）结果，以确定结直肠癌对放射治疗的反应[2]。

综上所述，TBP是一种关键的转录因子，它在基因表达的调控中发挥着重要作用。TBP的功能受到多种TBP相关蛋白的调节，包括SAGA复合物，这些蛋白通过与TBP相互作用，影响TBP在转录过程中的功能。此外，TBP的二聚化对于维持基因表达的精确调控是必要的。TBP在植物和人类癌症研究中的应用也表明，其在不同生物中的功能可能存在差异，并且其功能可能受到其他相关蛋白的调节。未来的研究需要进一步探索TBP在基因表达调控中的具体机制，以及其在不同生物学过程中的功能。

参考文献：
1. Lee, T I, Young, R A. . Regulation of gene expression by TBP-associated proteins. In Genes & development, 12, 1398-408. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9585500/
2. Kim, Shin, Park, Jee Young, Lee, Hye Won, Byun, Sang Jun, Seo, Incheol. 2023. YWHAZ and TBP are potential reference gene candidates for qPCR analysis of response to radiation therapy in colorectal cancer. In Scientific reports, 13, 12902. doi:10.1038/s41598-023-39488-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37558778/
3. Ben-Shem, Adam, Papai, Gabor, Schultz, Patrick. 2020. Architecture of the multi-functional SAGA complex and the molecular mechanism of holding TBP. In The FEBS journal, 288, 3135-3147. doi:10.1111/febs.15563. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32946670/
4. Jackson-Fisher, A J, Chitikila, C, Mitra, M, Pugh, B F. . A role for TBP dimerization in preventing unregulated gene expression. In Molecular cell, 3, 717-27. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/10394360/
5. Heard, D J, Kiss, T, Filipowicz, W. . Both Arabidopsis TATA binding protein (TBP) isoforms are functionally identical in RNA polymerase II and III transcription in plant cells: evidence for gene-specific changes in DNA binding specificity of TBP. In The EMBO journal, 12, 3519-28. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8253078/

资料下载

S-CKO-05753_6J_21374_Tbp_Exon 3_strategy.pdf
S-CKO-05753_6J_21374_Tbp_Exon 3_strategy.pdf
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