智鼠故事 
C57BL/6JCya-Tbpem1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
Tbp-flox
产品编号：
S-CKO-05753
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：Tbp-flox mice (Strain S-CKO-05753) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Tbpem1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-21374-Tbp-B6J-VA
产品编号
S-CKO-05753
基因名
Tbp
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
Gtf2d；SCA17；TFIID；GTF2D1
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
MGI:101838 Mice homozygous for one null allele exhibit embryonic lethality caused by hemorrhaging and clotting in the placenta and surviving embryos die prior to weaning. Mice homozygous for another null allele undergo growth arrest after hatching and apoptosis.
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Tbp位于小鼠的17号染色体，采用基因编辑技术，通过高通量电转受精卵方式，获得Tbp基因条件性敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
Tbp-flox小鼠模型由赛业生物（Cyagen）采用基因编辑技术构建。Tbp基因位于小鼠17号染色体上，由8个外显子组成，其中ATG起始密码子在2号外显子，TAG终止密码子在8号外显子。条件性敲除区域（cKO区域）位于3号外显子，包含374个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Tbp基因功能的丧失。此外，携带敲除等位基因的小鼠会出现胚胎期死亡或出生后生长停滞和凋亡。Tbp-flox小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白（RNP）和靶向载体共同注入受精卵。随后，对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。该模型可用于研究Tbp基因在小鼠体内的功能。
基因研究概述
TBP，即TATA盒结合蛋白（TATA-box binding protein），是一种在真核生物中广泛存在的转录因子，它参与了RNA聚合酶II转录的启动过程。TBP的主要功能是与TATA盒序列结合，这一序列通常位于基因启动子的核心区域，是许多基因转录启动所必需的。TBP与TATA盒的结合是形成转录起始复合物（pre-initiation complex, PIC）的关键步骤，PIC的进一步组装最终导致转录的启动[1]。
TBP的活性受到多种TBP相关蛋白的调节，这些蛋白通过与TBP相互作用，影响TBP与DNA的结合能力以及TBP在转录过程中的功能[1]。例如，SAGA转录共激活因子复合物在转录激活中起着重要作用，它不仅包含多个染色质修饰酶模块，还包括一个将TBP递送到基因启动子的模块。最近的研究表明，SAGA复合物中存在一个由八个组蛋白折叠结构域组成的八聚体核心，为TBP的结合提供了空间，并且其结构特点有助于减少与错误DNA序列的非特异性相互作用。这些结构上的特点为理解TBP如何被精确地递送到基因启动子上以及SAGA如何调节基因表达提供了结构基础[3]。
TBP在维持基因表达的调控中也发挥着重要作用。研究表明，TBP的二聚化对于防止其无调节的基因表达和自身的降解是必要的。在酵母中，TBP二聚化的缺陷会导致基因表达失控和TBP的快速降解[4]。这表明，TBP的二聚化可能在维持基因表达的精确调控中起着关键作用。
此外，TBP在植物中同样发挥着重要的功能。在拟南芥中，两个TBP同源物在RNA聚合酶II和III的转录中发挥着相同的功能，这表明植物中的TBP可能具有比酵母中更广泛的结合特异性[5]。这提示，TBP在不同生物中的功能可能存在差异，并且其功能可能受到其他相关蛋白的调节。
在人类癌症研究中，TBP也被作为基因表达研究的参考基因。最近的研究发现，TBP的表达在结直肠癌细胞系、类器官和患者组织中在辐射治疗后表现出了较高的稳定性，因此被认为是一种潜在的参考基因，用于标准化定量PCR（qPCR）结果，以确定结直肠癌对放射治疗的反应[2]。
综上所述，TBP是一种关键的转录因子，它在基因表达的调控中发挥着重要作用。TBP的功能受到多种TBP相关蛋白的调节，包括SAGA复合物，这些蛋白通过与TBP相互作用，影响TBP在转录过程中的功能。此外，TBP的二聚化对于维持基因表达的精确调控是必要的。TBP在植物和人类癌症研究中的应用也表明，其在不同生物中的功能可能存在差异，并且其功能可能受到其他相关蛋白的调节。未来的研究需要进一步探索TBP在基因表达调控中的具体机制，以及其在不同生物学过程中的功能。
参考文献：
1. Lee, T I, Young, R A. . Regulation of gene expression by TBP-associated proteins. In Genes & development, 12, 1398-408. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9585500/
2. Kim, Shin, Park, Jee Young, Lee, Hye Won, Byun, Sang Jun, Seo, Incheol. 2023. YWHAZ and TBP are potential reference gene candidates for qPCR analysis of response to radiation therapy in colorectal cancer. In Scientific reports, 13, 12902. doi:10.1038/s41598-023-39488-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37558778/
3. Ben-Shem, Adam, Papai, Gabor, Schultz, Patrick. 2020. Architecture of the multi-functional SAGA complex and the molecular mechanism of holding TBP. In The FEBS journal, 288, 3135-3147. doi:10.1111/febs.15563. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32946670/
4. Jackson-Fisher, A J, Chitikila, C, Mitra, M, Pugh, B F. . A role for TBP dimerization in preventing unregulated gene expression. In Molecular cell, 3, 717-27. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/10394360/
5. Heard, D J, Kiss, T, Filipowicz, W. . Both Arabidopsis TATA binding protein (TBP) isoforms are functionally identical in RNA polymerase II and III transcription in plant cells: evidence for gene-specific changes in DNA binding specificity of TBP. In The EMBO journal, 12, 3519-28. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8253078/
