PreP,全称为Prolyl endopeptidase,是一种在多种生物体中发现的酶,参与蛋白质的降解和细胞功能调控。PreP属于pitrilysin家族的蛋白酶,具有独特的结构特征,如倒置的锌结合基序。在植物中,PreP主要存在于线粒体和叶绿体中,负责降解靶向这些细胞器的蛋白质前体以及无结构的短肽。研究表明,PreP在植物的生长发育过程中发挥着重要作用,如参与淀粉的代谢、线粒体内膜的完整性维持以及线粒体呼吸等[2]。
在人类中,PreP的生理功能更为复杂。研究发现,PreP不仅在蛋白质降解中发挥作用,还参与转录调控,影响细胞的生理功能和疾病的发生。例如,在巨噬细胞中,PreP作为一种转录共调控因子,参与调节细胞的功能,抑制纤维化的发展[1]。此外,PreP还与阿尔茨海默病的发生有关,因为它负责降解脑线粒体中的β淀粉样肽[2]。
PreP在基因表达调控中的作用也引起了广泛关注。研究表明,PreP可以与转录因子结合,影响基因的表达[1]。此外,PreP还参与mRNA的稳定性调控,影响基因的表达水平[3]。
PreP的基因表达数据预处理工具PreP,是一种强大的、独立的软件应用程序,旨在对基因表达数据进行预处理。该软件提供了预处理基因表达数据的文档和可执行文件,用户可以访问http://chirimoyo.ac.uma.es/bitlab/services/index.htm获取更多详细信息[4]。
综上所述,PreP是一种多功能酶,在蛋白质降解、细胞功能调控和基因表达调控中发挥着重要作用。PreP的研究有助于深入理解细胞的生理功能和疾病的发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Lin, Shuang-Zhe, Wu, Wei-Jie, Cheng, Yu-Qing, Chen, Yuan-Wen, Fan, Jian-Gao. 2023. Prolyl endopeptidase remodels macrophage function as a novel transcriptional coregulator and inhibits fibrosis. In Experimental & molecular medicine, 55, 1437-1450. doi:10.1038/s12276-023-01027-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37394591/
2. Kmiec, Beata, Glaser, Elzbieta. 2011. A novel mitochondrial and chloroplast peptidasome, PreP. In Physiologia plantarum, 145, 180-6. doi:10.1111/j.1399-3054.2011.01531.x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21995547/
3. Mamdani, Firoza, Sequeira, Adolfo, Alda, Martin, Rouleau, Guy, Turecki, Gustavo. 2007. No association between the PREP gene and lithium responsive bipolar disorder. In BMC psychiatry, 7, 9. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17324276/
4. García de la Nava, Jorge, van Hijum, Sacha, Trelles, Oswaldo. . PreP: gene expression data pre-processing. In Bioinformatics (Oxford, England), 19, 2328-9. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14630668/