Krtap6-2-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Krtap6-2-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-03325

品系全称

C57BL/6JCya-Krtap6-2em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-16701-Krtap6-2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Krtap6-2-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-03325) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
keratin associated protein 6-2
基因别称
HGTpII.4
染色体号
Chr 16 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_010673.2 | Ensembl: ENSMUST00000082065
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~1262 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Krtap6-2,也称为Keratin-associated protein 6-2,是角蛋白相关蛋白(KAPs)家族中的一种。KAPs是毛发和羊毛纤维的基本结构成分,对纤维的某些性质有影响。KAPs可以分为三类:高硫(HS)KAPs、超高硫(UHS)KAPs和高甘氨酸-酪氨酸(HGT)KAPs。Krtap6-2属于HGT-KAP家族,主要编码富含甘氨酸和酪氨酸的蛋白质,这些蛋白质在毛发和羊毛纤维的形成和功能中发挥重要作用。

在山羊中,Krtap6-2基因的序列变异被发现会影响羊绒纤维的直径。在一项研究中,研究者发现了一个与绵羊Krtap6-2相似的252bp开放阅读框,其上游和下游序列与绵羊Krtap6-2密切相关,但与其他绵羊Krtap6-n序列明显不同。通过对该区域的聚合酶链反应扩增和单链构象多态性分析,研究者发现了五种不同的序列(A到E),代表了230只长东羊绒山羊中的五种不同序列。在这五种序列中,发现了11个二等位基因单核苷酸多态性(SNPs)、一个三核苷酸序列变异和一个12bp的插入/缺失。大多数SNPs位于编码区之外或为同义SNPs。研究发现,变异D的存在与平均纤维直径(MFD)的降低相关(存在:13.26±0.07 µm;不存在:13.55±0.04 µm;p<0.001),这表明Krtap6-2的变异可能影响纤维直径,并具有作为改善羊绒纤维直径性状的分子标记的价值[1]。

此外,在绵羊中,Krtap6-2基因的序列变异也被发现会影响羊毛的某些性状。另一项研究发现,在绵羊染色体1上存在一个与山羊Krtap6-2基因同源的区域。通过对该区域的PCR-SSCP分析,研究者发现了两种不同的PCR-SSCP条带模式,代表了两种不同的DNA序列。这两种序列与已知的绵羊Krtap序列没有很大的同源性,但与山羊和驯鹿的Krtap6-2序列具有高度序列同源性。这些结果表明,绵羊也具有Krtap6-2基因,并且这个基因具有多态性[2]。

为了进一步了解Krtap6-2基因家族的成员,研究者使用Krtap6编码序列搜索了绵羊基因组(v3.1),并发现了五个同源区域(R1-R5)。这些区域都包含一个开放阅读框,要么与绵羊皮肤表达序列标签(ESTs)相同,要么与之高度相似。系统发育分析显示,R1-R5与来自不同物种的KAP6序列聚集在一起,形成了一个与其他HGT-KAPs不同的群体。R1与已知的Krtap6-1序列非常相似,但其他基因似乎是新发现的。通过对96只羊的研究,所有这些基因的扩增子都被获得。对于Krtap6-2到Krtap6-5,分别观察到六、五、三和六种PCR-SSCP模式,代表了六、五、三和六种DNA序列。Krtap6-2和Krtap6-4分别有五个和三个SNPs。Krtap6-3有三个SNPs和一个45bp的插入/缺失,Krtap6-5有五个SNPs和一个18bp的插入/缺失。这些KAP6基因的等位基因频率在美利奴羊和罗姆尼羊之间存在差异[3]。

此外,Krtap6家族基因的表达模式也被研究。研究发现,Krtap6家族基因在生长期(anagen)与其他阶段相比显著表达(p<0.05)。这五个基因主要在真皮乳头、内根鞘和外根鞘中表达,并显示出独特的时空表达模式。还发现,Krtap6-1和Krtap6-5的mRNA表达与羊毛的平均纤维直径(MFD)和平均纤维强度(MSS)呈负相关(p<0.05)。这表明Krtap6-1和Krtap6-5可能通过改变表达来调节甘肃高山细羊毛羊的MFD和MSS[4]。

综上所述,Krtap6-2基因是KAPs家族中的一种重要成员,其序列变异和表达模式与羊毛和羊绒纤维的直径和强度相关。Krtap6-2基因的变异被发现可以影响纤维直径,并具有作为改善纤维直径性状的分子标记的价值。此外,Krtap6家族基因的时空表达模式也表明它们在羊毛的形成和功能中发挥重要作用。这些研究有助于深入了解Krtap6-2基因及其家族成员的生物学功能和在羊毛和羊绒纤维性状中的作用,为改善纤维质量和性状提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Cao, Jian, Wang, Jiqing, Zhou, Huitong, Luo, Yuzhu, Hickford, Jon G H. 2022. Sequence Variation in Caprine KRTAP6-2 Affects Cashmere Fiber Diameter. In Animals : an open access journal from MDPI, 12, . doi:10.3390/ani12162040. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36009630/
2. Gong, Hua, Zhou, Huitong, Dyer, Jolon M, Hickford, Jon Gh. 2014. The sheep KAP8-2 gene, a new KAP8 family member that is absent in humans. In SpringerPlus, 3, 528. doi:10.1186/2193-1801-3-528. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25279319/
3. Zhou, Huitong, Gong, Hua, Wang, Jiqing, Luo, Yuzhu, Hickford, Jon G H. 2016. Identification of four new gene members of the KAP6 gene family in sheep. In Scientific reports, 6, 24074. doi:10.1038/srep24074. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27045687/
4. Sun, Hongxian, He, Zhaohua, Zhao, Fangfang, Luo, Yuzhu, Li, Shaobin. 2024. Spatiotemporal Expression Characterization of KRTAP6 Family Genes and Its Effect on Wool Traits. In Genes, 15, . doi:10.3390/genes15010095. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38254984/