Cobl-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Cobl-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-01796

品系全称

C57BL/6JCya-Coblem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-12808-Cobl-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Cobl-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-01796) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
cordon-bleu WH2 repeat
基因别称
-
染色体号
Chr 11 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_172496.3 | Ensembl: ENSMUST00000046755
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 10
敲除长度
~789 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:105056Animals homozygous for this mutation do not display a phenotype. However, the allele exacerbates the neural tube defects seen in the loop tail mouse.
基因Cobl,也称为Cordon-bleu,是一种编码植物特异的糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚定蛋白的基因。这种蛋白质在细胞壁中纤维素的沉积和细胞进展中起着关键作用,通过影响细胞壁的微纤丝取向来控制细胞扩张的方向。Cobl基因及其编码的蛋白质在植物的生长、发育和对环境胁迫的响应中发挥着重要作用。

在小麦中,Cobl基因的突变导致了植物组织的脆性增加,这是由于细胞结构的变化,包括每单位面积的大型维管束数量减少、厚壁组织细胞壁变薄和薄壁组织增宽[1]。这种突变通过MapRseq方法被克隆,该方法结合了先前的目标基因定位信息、单核苷酸多态性(SNP)调用和从野生型和表现出突变表型的BC3F2群体的RNA_seq数据中发现的差异表达基因。Cobl基因的突变导致COBRA结构域编码区域的终止密码子提前出现,从而影响了蛋白质的功能。将Cobl基因引入拟南芥AtCOBL4突变体中可以挽救其表型,这表明Cobl基因在不同植物中具有功能保守性[1]。

在人类中,Cobl基因与7p12上的印记基因GRB10相邻,尽管Cobl基因在7p11.2-p13 SRS复制区域中与GRB10相邻,但并没有表现出印记现象。Cobl基因在人类和小鼠中都是双等位基因表达的,这与GRB10的印记模式形成对比[2]。

在啤酒花中,通过全基因组鉴定和激素响应分析,发现了13个Cobl基因。这些基因的蛋白质大多数具有信号肽结构,并且定位于质膜上。通过qRT-PCR分析发现,茉莉酸(JA)是HvCOBL基因表达的主要激素调节因子[3]。

在棉花中,通过全基因组分析发现了19个、18个和33个候选Cobl基因,分别来自二倍体棉花G. raimondii、G. arboreum和四倍体棉花G. hirsutum acc. TM-1。这些基因在棉花纤维发育的不同阶段表现出高度的发展和空间调节。其中,GhCOBL9和GhCOBL13在纤维次生细胞壁发育阶段优先表达,并且与纤维素合成酶基因GhCESA4、GhCESA7和GhCESA8的表达显著上调。这些结果表明,GhCOBL9和GhCOBL13可能对纤维发育有重要作用[4]。

在杨树中,PtrCOBL基因家族的成员被发现在木质部分化组织和木质素形成中起着调节作用。PtrCOBL基因在植物茎和叶组织中表达丰富,对环境刺激有反应。PtrCOBL2和PtrCOBL3在所有非生物胁迫和木质部发育组织中都是中心基因,表明它们在木质部分化组织和非生物胁迫耐受性中起着重要作用[5]。

在小麦中,通过数据库搜索和结构预测发现了五个Cobl基因,即TaCOBL 1、TaCOBL 2、TaCOBL 3、TaCOBL 4和TaCOBL 5。这些基因被定位在小麦的同源群2、4、5、6和7上。基因本体分析表明,TaCOBL基因参与纤维素微纤丝组织、种子发育过程中粘液素生物合成过程、植物型细胞壁生物发生、植物型细胞壁纤维素生物合成过程、种子发育和种子发育。qRT-PCR分析表明,TaCOBL基因是干旱响应的,并且可以进一步探索它们在小麦干旱耐受中的作用[6]。

在儿童中,Cobl基因与肥胖相关的代谢功能障碍有关。Cobl基因的表达与棕色脂肪组织(BAT)的发育有关,而BAT具有能量消散的功能,可能对肥胖和相关的代谢功能障碍有保护作用。Cobl基因的表达与肥胖和脂肪组织功能障碍和代谢疾病有关,如脂肪细胞大小、瘦素水平和HOMA-IR[7]。

在小鼠中,Cobl基因在缺血性中风后的树突分支再生中起着关键作用。中风和兴奋毒性会导致Cobl水平显著降低,但Cobl的mRNA表达随后增加,Cobl在缺血性中风后的树突分支修复中起着关键作用。在Cobl敲除(KO)小鼠中,中风后树突修复的窗口期没有树突分支再生,这表明Cobl在缺血性中风后的树突分支修复中起着重要作用[8]。

综上所述,Cobl基因及其编码的蛋白质在植物和动物中发挥着重要作用,包括植物细胞壁的生物合成、植物的生长发育、对环境胁迫的响应、植物和动物的组织再生和发育、以及与人类肥胖和代谢功能障碍相关的生理过程。Cobl基因的研究有助于深入理解植物和动物中细胞壁生物合成和组织再生的分子机制,以及与人类健康和疾病相关的生理过程。

参考文献:
1. Deng, Qingyan, Kong, Zhongxin, Wu, Xiaoxia, Jia, Haiyan, Ma, Zhengqiang. 2019. Cloning of a COBL gene determining brittleness in diploid wheat using a MapRseq approach. In Plant science : an international journal of experimental plant biology, 285, 141-150. doi:10.1016/j.plantsci.2019.05.011. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31203879/
2. Hitchins, Megan P, Bentley, Louise, Monk, David, Stanier, Philip, Moore, Gudrun E. . DDC and COBL, flanking the imprinted GRB10 gene on 7p12, are biallelically expressed. In Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society, 13, 686-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12514746/
3. Ren, Panrong, Ma, Liang, Bao, Wei, Wang, Jie. 2024. Genome-Wide Identification and Hormone Response Analysis of the COBL Gene Family in Barley. In Genes, 15, . doi:10.3390/genes15050612. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38790240/
4. Niu, Erli, Shang, Xiaoguang, Cheng, Chaoze, Du, Xiongming, Guo, Wangzhen. 2015. Comprehensive Analysis of the COBRA-Like (COBL) Gene Family in Gossypium Identifies Two COBLs Potentially Associated with Fiber Quality. In PloS one, 10, e0145725. doi:10.1371/journal.pone.0145725. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26710066/
5. Sajjad, Muhammad, Ahmad, Adeel, Riaz, Muhammad Waheed, Yasir, Muhammad, Lu, Meng-Zhu. 2023. Recent genome resequencing paraded COBRA-Like gene family roles in abiotic stress and wood formation in Poplar. In Frontiers in plant science, 14, 1242836. doi:10.3389/fpls.2023.1242836. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37780503/
6. Zaheer, Muhammad, Rehman, Shoaib Ur, Khan, Sultan Habibullah, Naz, Rabia, Sajjad, Muhammad. 2021. Characterization of new COBRA like (COBL) genes in wheat (Triticum aestivum) and their expression analysis under drought stress. In Molecular biology reports, 49, 1379-1387. doi:10.1007/s11033-021-06971-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34800231/
7. Abdul Majeed, Sarah, Dunzendorfer, Helene, Weiner, Juliane, Körner, Antje, Landgraf, Kathrin. 2023. COBL, MKX and MYOC Are Potential Regulators of Brown Adipose Tissue Development Associated with Obesity-Related Metabolic Dysfunction in Children. In International journal of molecular sciences, 24, . doi:10.3390/ijms24043085. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36834493/
8. Carroll, Elizabeth A, Gerrelli, Dianne, Gasca, Stéphan, Copp, Andrew J, Klingensmith, John. . Cordon-bleu is a conserved gene involved in neural tube formation. In Developmental biology, 262, 16-31. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14512015/