Tpr-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Tpr-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-00728

品系全称

C57BL/6JCya-Tprem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-108989-Tpr-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Tpr-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-00728) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
translocated promoter region, nuclear basket protein
基因别称
2610029M07Rik
染色体号
Chr 1 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_133780.3 | Ensembl: ENSMUST00000124973
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 9~10
敲除长度
~749 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因Tpr,也称为Tetratricopeptide repeat(TPR)基因,是一类广泛存在于生物体中的基因家族,其编码的蛋白质包含TPR保守基序。TPR结构域是一种蛋白质结构域,由34个氨基酸残基组成,通常成对出现,形成螺旋结构。TPR结构域在蛋白质间相互作用、蛋白质折叠和稳定性等方面发挥重要作用。TPR基因在多种生物过程中具有重要作用,包括细胞周期调控、基因表达、蛋白质降解等。

在植物中,TPR基因家族参与植物的生长发育和抗逆性。例如,在番茄中,研究人员通过生物信息学方法鉴定了26个TPR基因家族成员,并对其进行了亚细胞定位、系统发育进化、保守基序、组织表达和GO(Gene Ontology)分析。研究发现,番茄TPR基因家族成员在干旱、脱落酸(ABA)和灰霉菌(Botrytis cinerea)等生物和非生物胁迫下表达水平显著变化。进一步的研究表明,SlTPR2和SlTPR4基因在受到不同胁迫时表达水平显著变化,使用VIGS(Virus-induced gene silencing)技术沉默这两个基因后,沉默植株的病害抗性降低。这表明番茄TPR基因家族成员在植物抗病性中发挥重要作用[1]。

在动物中,TPR基因家族成员也参与多种生物学过程。例如,人源KDM6A(Lysine demethylase 6A)蛋白含有六个TPR结构域,是一种组蛋白H3赖氨酸27(H3K27)去甲基化酶。KDM6A在细胞分化、发育和癌症中发挥重要作用。KDM6A与组蛋白H3赖氨酸4单甲基转移酶MLL3(KMT2C)和MLL4(KMT2D)相互作用,调控基因表达。KDM6A的突变会导致Kabuki综合征,而KDM6A在癌症中频繁发生突变,作为肿瘤抑制因子发挥作用。KDM6A的酶活性在特定细胞环境中是必需的。KDM6A的功能冗余与其H3K27去甲基化酶活性在体内的作用机制尚未完全确定[2]。

此外,TPR基因家族成员还与其他蛋白质相互作用,参与细胞信号传导。例如,在一种新型ROS1融合基因中,TPR结构域与ROS1融合,激活MAPK、PI3K和JAK/STAT信号通路,导致ERK、AKT、STAT和S6的磷酸化水平升高。这表明TPR结构域在细胞信号传导中发挥重要作用[3]。

综上所述,TPR基因家族在植物和动物中发挥重要作用,参与细胞周期调控、基因表达、蛋白质降解、细胞信号传导等多种生物学过程。TPR基因家族成员在植物抗病性和动物生长发育、癌症等方面具有重要作用。深入研究TPR基因家族的功能和作用机制,有助于我们更好地理解生物体生长发育和疾病发生机制,为植物抗病育种和疾病治疗提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Zhou, Xi'nan, Zheng, Yangyang, Cai, Zhibo, Zhang, Yao, Wang, Aoxue. 2021. Identification and Functional Analysis of Tomato TPR Gene Family. In International journal of molecular sciences, 22, . doi:10.3390/ijms22020758. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33451131/
2. Tran, Nhien, Broun, Aaron, Ge, Kai. 2020. Lysine Demethylase KDM6A in Differentiation, Development, and Cancer. In Molecular and cellular biology, 40, . doi:10.1128/MCB.00341-20. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32817139/
3. Deland, Lily, Keane, Simon, Bontell, Thomas Olsson, Sabel, Magnus, Abel, Frida. . Novel TPR::ROS1 Fusion Gene Activates MAPK, PI3K and JAK/STAT Signaling in an Infant-type Pediatric Glioma. In Cancer genomics & proteomics, 19, 711-726. doi:10.21873/cgp.20354. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36316040/