Rab15-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Rab15-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-00420

品系全称

C57BL/6JCya-Rab15em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-104886-Rab15-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Rab15-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-00420) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
RAB15, member RAS oncogene family
基因别称
2310012G06Rik
染色体号
Chr 12 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_134050 | Ensembl: ENSMUST00000021459
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3~4
敲除长度
~1.7 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Rab15是Rab家族成员之一,是一类低分子量GTP结合蛋白,具有在脑组织中特异性表达的特点。Rab蛋白是一类重要的细胞质蛋白,参与细胞内膜转运途径的调控,对细胞分化、肿瘤发生和发展等过程起着关键作用。Rab15在神经母细胞瘤细胞的分化过程中发挥重要作用,其表达水平与维甲酸诱导的神经母细胞瘤细胞分化相关。研究表明,Rab15CN和Rab15AN是Rab15在神经母细胞瘤细胞中存在的两种选择性剪接异构体,其中Rab15CN在脑组织中特异性表达,而Rab15AN主要在睾丸组织中表达。维甲酸能够诱导神经母细胞瘤BE(2)-C细胞的神经分化,并特异性上调Rab15CN的表达。此外,在来自高风险患者的神经母细胞瘤细胞中,维甲酸诱导的分化过程中也观察到Rab15CN表达的上调。这些结果表明,Rab15的表达与维甲酸诱导的神经母细胞瘤细胞分化相关[1]。

Rab15是一种在脑组织中特异性表达的GTP结合蛋白,与Rab3A具有相似的基因表达模式。Rab3A在神经末梢的突触囊泡中表达,并参与调节神经递质的释放。Rab15的发现表明,它可能在调节突触囊泡膜流方面与Rab3A协同作用。然而,Rab15在神经母细胞瘤中的功能和作用机制尚未完全明确[2]。

遗传性球形细胞增多症(HS)是一种由红细胞膜缺陷引起的遗传性疾病,表现为溶血性贫血和球形红细胞增多。研究发现,一个5个月大的韩国女孩患有HS,其病因是14q23.3染色体上的SPTB基因发生了271 Kb的微缺失。该缺失区域包含了SPTB、CHURC1、GPX2、RAB15、FNTB和MAX等基因。通过靶向下一代测序(NGS)分析,发现SPTB基因的5'非翻译区、外显子1和部分内含子1受到了影响。这表明,NGS技术可以用于检测HS患者中的疾病相关拷贝数变异(CNVs)和点突变。此外,染色体微阵列分析对于确定HS诊断中的联合缺失基因也具有重要作用[3]。

食管腺癌(EAC)是一种常见的食管癌类型,具有较差的预后。研究发现,RAB15是EAC中的预后相关基因之一。通过生物信息学分析,确定了与EAC预后相关的关键基因和miRNA。研究结果表明,RAB15的表达与EAC患者的总体生存和复发无病生存相关。此外,RAB15在EAC组织中的表达水平升高也得到了验证。这些预后相关基因和差异表达的miRNA可能成为EAC诊断和治疗的新型生物标志物[4]。

在肝细胞癌(HCC)中,Rab15的表达水平升高与ADAR2介导的miR-214和miR-122前体和反义RNA转录本的编辑相关。研究发现,ADAR2的过表达导致miR-214和miR-122的表达水平降低,进而导致其靶基因Rab15的表达水平升高。这一发现揭示了RNA编辑在HCC中调节特定miRNA生物发生的新机制[5]。

在结直肠癌(CRC)中,Rab15的表达与预后和免疫治疗反应相关。研究发现,RAB15是CRC中的预后相关基因之一。通过对CRC患者样本的分析,发现RAB15的表达与不良预后相关。此外,RAB15的表达与结直肠癌的代谢激活亚型(CMS3)相关,并与细胞周期相关通路富集相关。这些结果表明,RAB15可能在结直肠癌的细胞代谢和肿瘤生长中发挥重要作用,并可能成为预测预后和免疫治疗反应的潜在生物标志物[6]。

在神经元的分化和亚型特异性中,Rab15是Atoh1(Math1)转录因子的一个直接靶基因。研究发现,Atoh1在哺乳动物背侧脊髓中指定了不同的神经元亚型,包括dI1(背侧中间神经元1)群体。通过微阵列分析和染色质免疫沉淀测序实验,确定了Rab15是Atoh1在体内的神经元亚型特异性靶基因之一。Rab15与Klf7、Rassf4、Selm和Smad7等其他基因一起,具有不同的功能,包括转录因子、内吞作用和信号通路的调节。Rab15和Selm在Atoh1指定的神经元亚型中表达,包括发育中的小脑外部颗粒细胞层、内耳毛细胞和Merkel细胞。这些发现表明,神经元分化bHLH转录因子具有亚型特异性靶基因,而Rab15是其中一个重要的亚型特异性靶基因[7]。

在山羊的胴体和肉质性状研究中,发现RAB15基因与体重相关。通过全基因组关联分析(GWAS)和通路分析,确定了与体重和体形性状相关的SNPs和候选基因。研究发现,RAB15基因是体重性状的一个重要候选基因,其突变与山羊的体重和肉质性状相关。这些发现为山羊的遗传改良和育种提供了重要的分子标记[8]。

综上所述,Rab15是一种重要的Rab家族成员,在神经母细胞瘤、遗传性球形细胞增多症、食管腺癌、肝细胞癌、结直肠癌和山羊的胴体和肉质性状中发挥着重要作用。Rab15的表达与维甲酸诱导的神经母细胞瘤细胞分化相关,并且与多种疾病的预后相关。此外,Rab15还与神经元的分化和亚型特异性相关。这些研究表明,Rab15在多种生物学过程中发挥着重要作用,并可能成为疾病诊断、治疗和预防的潜在靶点和生物标志物。

参考文献:
1. Nishimura, Noriyuki, Van Huyen Pham, Thi, Hartomo, Tri Budi, Nishio, Hisahide, Matsuo, Masafumi. 2011. Rab15 expression correlates with retinoic acid-induced differentiation of neuroblastoma cells. In Oncology reports, 26, 145-51. doi:10.3892/or.2011.1255. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21491086/
2. Elferink, L A, Anzai, K, Scheller, R H. . rab15, a novel low molecular weight GTP-binding protein specifically expressed in rat brain. In The Journal of biological chemistry, 267, 5768-75. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1313420/
3. Jang, Woori, Kim, Jiyeon, Chae, Hyojin, Park, Chan-Jeoung, Kim, Yonggoo. 2019. Hereditary spherocytosis caused by copy number variation in SPTB gene identified through targeted next-generation sequencing. In International journal of hematology, 110, 250-254. doi:10.1007/s12185-019-02630-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30903564/
4. Dong, Zhiyu, Wang, Junwen, Zhan, Tingting, Xu, Shuchang. 2018. Identification of prognostic risk factors for esophageal adenocarcinoma using bioinformatics analysis. In OncoTargets and therapy, 11, 4327-4337. doi:10.2147/OTT.S156716. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30100738/
5. Liu, Wan-Hsin, Chen, Chao-Hung, Yeh, Kun-Huei, Chen, Pei-Jer, Yeh, Shiou-Hwei. 2013. ADAR2-mediated editing of miR-214 and miR-122 precursor and antisense RNA transcripts in liver cancers. In PloS one, 8, e81922. doi:10.1371/journal.pone.0081922. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24386085/
6. Jiang, Xuefei, Yang, Lanlan, Gao, Qianling, Ye, Shubiao, Yang, Zihuan. 2022. The Role of RAB GTPases and Its Potential in Predicting Immunotherapy Response and Prognosis in Colorectal Cancer. In Frontiers in genetics, 13, 828373. doi:10.3389/fgene.2022.828373. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35154286/
7. Lai, Helen C, Klisch, Tiemo J, Roberts, Rene, Zoghbi, Huda Y, Johnson, Jane E. . In vivo neuronal subtype-specific targets of Atoh1 (Math1) in dorsal spinal cord. In The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience, 31, 10859-71. doi:10.1523/JNEUROSCI.0445-11.2011. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21795538/
8. Selionova, Marina, Aibazov, Magomet, Sermyagin, Alexander, Zharkova, Ekaterina, Zinovieva, Natalia. 2023. Genome-Wide Association and Pathway Analysis of Carcass and Meat Quality Traits in Karachai Young Goats. In Animals : an open access journal from MDPI, 13, . doi:10.3390/ani13203237. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37893961/