Tdp1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Tdp1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-00418

品系全称

C57BL/6JCya-Tdp1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-104884-Tdp1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Tdp1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-00418) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1
基因别称
2810481F14Rik,4921509N21Rik,E430034L06Rik,Gm40556,MLZ-501,SCAN1
染色体号
Chr 12 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_028354 | Ensembl: ENSMUST00000153627
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3~4
敲除长度
~2.1 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1920036Mice homozygous for a null allele exhibit defective single strand DNA repair in neurons, decreased cerebellum size and increased sensitivity to topotecan.
TDP1(Tyrosyl-DNA Phosphodiesterase 1),也称为酪氨酸-DNA磷酸二酯酶1,是一种重要的DNA修复蛋白。它主要负责修复DNA拓扑异构酶I(TOP1)在转录过程中形成的共价复合物,这些复合物被称为TOP1cc(Topoisomerase I cleavage complexes)。TDP1通过水解TOP1催化酪氨酸与DNA 3'-端的共价键,从而释放DNA链,恢复其正常的结构。此外,TDP1还参与其他类型的DNA损伤修复,包括单链断裂(SSBs)和双链断裂(DSBs)。TDP1的缺失或功能障碍会导致DNA损伤积累,进而引发基因组不稳定和细胞死亡。

研究表明,TDP1在多种生物过程中发挥重要作用,包括细胞周期、细胞死亡、细胞粘附和通讯、线粒体功能、神经退行性疾病等。TDP1的缺失或功能障碍还与多种疾病的发生发展密切相关,包括神经退行性疾病、癌症等。

在神经退行性疾病方面,TDP1的突变会导致SCAN1(Spinocerebellar Ataxia with Neuropathy 1)神经退行性综合征,这是一种常染色体显性遗传病,主要表现为进行性小脑共济失调、周围神经病变和眼球运动障碍。研究发现,TDP1突变导致其功能丧失,进而导致TOP1cc的积累和DNA损伤,最终引发神经退行性疾病[1]。

在癌症方面,TDP1的表达和功能与肿瘤的发生发展密切相关。研究发现,TDP1的表达水平与肿瘤的侵袭性和转移能力相关,TDP1的高表达与不良预后相关。此外,TDP1还参与DNA损伤修复和细胞死亡等过程,其功能丧失会导致DNA损伤积累,进而引发基因组不稳定和肿瘤的发生发展[3]。

除了在人类疾病中的作用,TDP1还在其他生物中发挥重要作用。例如,在植物中,TDP1具有两个基因,分别为TDP1α和TDP1β,它们具有不同的结构域和功能。TDP1α参与DNA损伤修复,而TDP1β则参与DNA复制和细胞周期调控[2]。

综上所述,TDP1是一种重要的DNA修复蛋白,参与多种生物过程和疾病的发生发展。研究TDP1的功能和机制对于深入理解DNA损伤修复的生物学功能和疾病发生机制具有重要意义,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Geraud, Mathéa, Cristini, Agnese, Salimbeni, Simona, Capranico, Giovanni, Sordet, Olivier. 2024. TDP1 mutation causing SCAN1 neurodegenerative syndrome hampers the repair of transcriptional DNA double-strand breaks. In Cell reports, 43, 114214. doi:10.1016/j.celrep.2024.114214. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38761375/
2. Mutti, Giacomo, Raveane, Alessandro, Pagano, Andrea, Balestrazzi, Alma, Macovei, Anca. 2020. Plant TDP1 (Tyrosyl-DNA Phosphodiesterase 1): A Phylogenetic Perspective and Gene Expression Data Mining. In Genes, 11, . doi:10.3390/genes11121465. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33297410/
3. Marsh, Sharon, Hoskins, Janelle M. . Irinotecan pharmacogenomics. In Pharmacogenomics, 11, 1003-10. doi:10.2217/pgs.10.95. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20602618/