KO单克隆是指所有细胞均由一个测序验证的纯合子细胞增殖而来的，所有细胞的基因型都是一样的。KO cell pool是指没经过单克隆化和筛选的细胞池，因此可以理解为这群细胞中包含KO纯合子，杂合子和野生型，我们在拿到KO cell pool后须根据后续的实验需求挑取单克隆。

当需要去除细胞群体干扰因素的时候，推荐使用单克隆稳定细胞株，其基因组背景相对单一，对实验结果干扰因素小。当进行系统生物学研究时，需考虑细胞群体因素，同时由于不同细胞个体差异大，而且不同整合位点的单克隆细胞株表现出来的细胞行为可能不一致，所以许多实验使用混合克隆株更能去除细胞间差异造成的干扰。因此，选择单克隆细胞株还是混合克隆细胞株，需要根据实验目的而定。